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    生物信息學服務
    共發生網絡(Co-occurrence)
    【添加時間:2016-09-12 09:35:08】【來源:】【作者:dggadmin】
            Co-occurrence網絡可以揭示微生物群落中菌群之間的生態學關系。在正相關為主的網絡中,網絡模塊(module)相當于適應同一生態位的菌群,它們傾向于共發生。通過Mantel test可以找出影響這些模塊的關鍵環境因子。每個網絡包含的樣品數目最好不低于8個。  
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    圖1 兩個Co-occurrence網絡
            ?圖中的節點表示OTU,邊(兩節點之間的連線)表示兩個OTU存在顯著正相關(Spearman ρ>0.6, p<0.01)。節點大小表示該節點的邊數目多少,邊的粗細代表相關性大小,顏色代表同一模塊,節點標簽是OTU所屬菌群分類。



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