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Mantel test
【添加時(shí)間：2016-09-12 09:41:19】【來(lái)源：】【作者：dggadmin】
普通的相關(guān)分析只能檢驗(yàn)單個(gè)環(huán)境因子與單個(gè)微生物類群(例如單個(gè)屬)之間的相關(guān)性，而基于距離矩陣的Mantel test可以檢驗(yàn)單個(gè)或一組環(huán)境因子與整個(gè)微生物群落的相關(guān)性。Mantel test的相關(guān)性越大，p值越小，則說(shuō)明環(huán)境因子對(duì)微生物群落的影響越大。不僅如此，它的偏分析(partial Mantel test)可以排除環(huán)境因子之間自相關(guān)的干擾。
例如，采樣點(diǎn)的地理距離可以看成一組環(huán)境因子，土壤的各種理化參數(shù)可以看成另一組環(huán)境因子。partial Mantel test可以屏蔽土壤理化參數(shù)的影響，單獨(dú)檢驗(yàn)地理距離與整個(gè)微生物群落的相關(guān)性。
例如，采樣點(diǎn)的地理距離可以看成一組環(huán)境因子，土壤的各種理化參數(shù)可以看成另一組環(huán)境因子。partial Mantel test可以屏蔽土壤理化參數(shù)的影響，單獨(dú)檢驗(yàn)地理距離與整個(gè)微生物群落的相關(guān)性。
表1 Mantel test 揭示環(huán)境因子與菌群結(jié)構(gòu)的相關(guān)性(P表示顯著水平)
表格出處：Rui J, Li J, Wang S, An J, Liu W-t, Lin Q, Yang Y, He Z, Li X 2015. Responses of bacterial communities to simulated climate changes in alpine meadow soil of Qinghai-Tibet plateau. Applied and Environmental Microbiology 81: 6070–6077
