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Mantel test
【添加時(shí)間:2016-09-12 09:41:19】【來(lái)源:】【作者:dggadmin】
       普通的相關(guān)分析只能檢驗單個(gè)環(huán)境因子與單個(gè)微生物類(lèi)群(例如單個(gè)屬)之間的相關(guān)性,而基于距離矩陣的Mantel test可以檢驗單個(gè)或一組環(huán)境因子與整個(gè)微生物群落的相關(guān)性。Mantel test的相關(guān)性越大,p值越小,則說(shuō)明環(huán)境因子對微生物群落的影響越大。不僅如此,它的偏分析(partial Mantel test)可以排除環(huán)境因子之間自相關(guān)的干擾。
      例如,采樣點(diǎn)的地理距離可以看成一組環(huán)境因子,土壤的各種理化參數可以看成另一組環(huán)境因子。partial Mantel test可以屏蔽土壤理化參數的影響,單獨檢驗地理距離與整個(gè)微生物群落的相關(guān)性。  


表1 Mantel test 揭示環(huán)境因子與菌群結構的相關(guān)性(P表示顯著(zhù)水平)
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表格出處:Rui J, Li J, Wang S, An J, Liu W-t, Lin Q, Yang Y, He Z, Li X 2015. Responses of bacterial communities to simulated climate changes in alpine meadow soil of Qinghai-Tibet plateau. Applied and Environmental Microbiology 81: 6070–6077



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